Análisis comparativo de la expresión de proteinas de Tislia consotesis en respuesta a cambios de la salinidad externa
Mostra/ Apri
Data
2015Autore
Rubiano Labrador, CarolinaDirettore
Baena Garzón, SandraPublishers
Pontificia Universidad Javeriana
facoltà
Facultad de Ciencias
programma
Doctorado en Ciencias Biológicas
Titolo ottenuto
Doctor en Ciencias Biológicas
Tipo
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctorado
COAR
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Metadata
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Sommario
En este estudio se evaluó el perfil de expresión de proteínas de Tistlia consotensis bajo condiciones variables de salinidad (0 y 40 g·l-1 NaCl) empleando dos estrategias proteómicas. En la primera estrategia, se utilizó la técnica de electroforesis bidimensional para realizar un análisis cualitativo de la expresión de proteínas de T. consotensis bajo las salinidades evaluadas y posteriormente se realizó un estudio detallado utilizando una estrategia proteogenómica, que consistió en una anotación rápida de los genes cuyos productos se detectaron mediante espectrometría de masas. El análisis cualitativo de la expresión de proteínas de T. consotensis en respuesta a cambios en la salinidad del medio permitió determinar que esta bacteria halotolerante responde al estrés osmótico con cambios en los niveles de expresión de sus proteínas. Asimismo, el análisis del exoproteoma y del proteoma celular de T. consotensis, utilizando el enfoque proteogenómico, permitió la detección de proteínas específicas a 0 y 40 g·l-1 NaCl involucradas en los mecanismos de adaptación de T. consotensis bajo estrés hipo e hiper-osmótico a través de la comparación con el perfil de expresión en la condición de crecimiento a la salinidad óptima, 5 g·l-1 NaCl. En ausencia de sal, T. consotensis aumenta la producción de proteínas de estrés general y proteínas implicadas en la modulación de la composición de membrana celular. En respuesta a un incremento de la salinidad, T. consotensis aumenta la abundancia de proteínas involucradas con procesos de señalización, responsables de detectar eficientemente cambios en la concentración de Cl-, y proteínas relacionadas con diferentes tipo de sistemas de transporte encargados de acumular solutos compatibles y mantener el exceso de Na+ fuera de la célula. Este estudio proporcionó una visión detallada de la adaptación celular, en términos de perfiles proteómicos, a cambios en la salinidad externa en T. consotensis, sugiriendo que esta bacteria halotolerante combina diferentes estrategias novedosas para contrarrestar los cambios de salinidad en su hábitat.
Astratto
In this study the protein expression profile of Tistlia consotensis under different salinities (0 to 40 g·l-1 NaCl) were evaluated using two proteomic strategies. In the first strategy, two- mensional electrophoresis technique was used to perform a qualitative analysis of protein expression of T. consotensis under salinities evaluated and subsequently a detailed study was performed using proteogenomics strategy, which consisted of a quick annotation of genes whose products were detected by mass spectrometry. Qualitative analysis of protein expression of T. consotensis in response to changes in the salinity allowed determining that this halotolerant bacterium respond to osmotic stress with changes in the expression levels of proteins. Moreover, analysis of exoproteome and proteome cellular of T. consotensis, using the proteogenómico approach, allowed the detection of specific proteins to 0 and 40 g·l -1 NaCl involved in adaptation mechanisms of T. consotensis under hypo and hyperosmotic stress by comparison with the expression profile in the condition of the optimal growth salinity, 5 g·l-1 NaCl. In the absence of salt, T. consotensis increases the production of proteins of general stress and proteins involved in the modulation of cell membrane composition. In response to an increase of salinity, T. consotensis increases the abundance of proteins involved in signaling processes, responsible for efficiently detect changes in the concentration of Cl-, and proteins related to different types of transport systems responsible for accumulating compatible solutes and maintaining excess Na+ out of the cell. This study provided a detailed overview of cell adaptation, in terms of proteomic profiles, to changes in the external salinity in T. consotensis, suggesting that this halotolerant bacterium combines different innovative strategies to counteract changes in salinity in their habitat.
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