Detección de arqueas y virus presentes en pacientes con cáncer oral a partir de análisis metagenómicos
Data
2019-12-05Autor(es)
Garcia Robayo, Dabeiba AdrianaBernal Vélez, Camilo Javier
García Quiñones, Malory Daniela
Hernández Sánchez, Paola
Publisher
Pontificia Universidad Javeriana
Faculdade
Facultad de Odontología
Programa
Especialización en Patología y Cirugía Bucal
Título obtido
Especialista en Patología y Cirugía Bucal
Tipo
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Especialización
Compartilhe este registro
Citación
Metadata
Mostrar registro completo
Documentos PDF
Título em inglês
Detection of archaea and viruses present in patients with oral cancer through metagenomic analysisResumo
Antecedentes: La cavidad oral alberga diversos microorganismos (arqueas, hongos bacterias y virus) constituyentes del microbiota oral; su estudio ha establecido que su disbiosis está relacionada con enfermedades como el Carcinoma Escamocelular Oral (CECO). Gracias a la secuenciación de última generación (NGS) se ha podido estudiar a fondo esta microbiota, pero en CECO, su descripción es escasa. Aunque se han identificado virus y arqueas relacionados con cáncer en otros sitios anatómicos no se ha determinado su presencia de manera diferencial en múltiples microambientes orales, que incluya muestras de pacientes con CEOC. Objetivo: Identificar presencia de virus y arqueas presentes en muestras de pacientes con cáncer oral. Métodos: Estudio observacional descriptivo. En muestras de saliva, placa, tumor de 10 pacientes con CECO. saliva y placa de 10 controles, se realizó NGS. A partir de los datos obtenidos se seleccionaron cuatro microorganismos de interés (Methanobrevibacter sp AbM4-arquea y Lactobacillus phague KC5a-virus asociados a enfermedad y Candidatus Methanomethylophilus alvus-arquea, Campylobacter CP220-virus asociados a salud) Posteriormente, se realizó PCR convencional para identificar dichos microorganismos en nuevas muestras de tejido tumoral de 36 pacientes con diagnóstico de CECO. Se realizaron análisis cualitativos, cuantitativos y estadístico con la prueba X2 para determinar diferencias estadísticamente significativas entre la presencia de estos microorganismos y características sociodemográficas. Resultados. Mbb, Ca alvus, Cp220, kc5a fueron positivos en 8%, 25%, 42% y 36%, con una concentración media de 43735, 324.9, 44.03 y 33.68 respectivamente. Mbb y Ca alvus mostraron diferencias estadísticamente significativas frente al sexo oral (p: 0.0431) y reflujo gastroesofágico (p: 0.04965) respectivamente. Conclusión: Arquea y virus candidatos de enfermedad tuvieron una frecuencia del 8% y 36% respectivamente. mientras que la arquea y virus relacionados con salud presentaron frecuencia de 25% y 42 %.
Abstract
Background: The oral cavity harbors various microorganisms (archaea, fungal bacteria and viruses) constituents of the oral microbiota; His study has established that his dysbiosis is related to diseases such as Oral Squamous Cell Carcinoma (CECO). Thanks to the latest generation sequencing (NGS) it has been possible to study this microbiota in depth, but in CECO, its description is scarce. Although cancer-related viruses and archaea have been identified in other anatomical sites, their presence has not been differentially determined in multiple oral microenvironments, which includes samples from patients with CEOC. Objective: To identify the presence of viruses and archaea present in samples of patients with oral cancer. Methods: Descriptive observational study. In samples of saliva, plaque, tumor of 10 patients with CECO. Saliva and 10 controls plate, NGS was performed. From the data obtained, four microorganisms of interest were selected (Methanobrevibacter sp AbM4-arquea and Lactobacillus phague KC5a-virus associated with disease and Candidatus Methanomethylophilus alvus-arquea, Campylobacter CP220-virus associated with health) Subsequently, conventional PCR was performed to identify these microorganisms in new samples of tumor tissue from 36 patients diagnosed with CECO. Qualitative, quantitative and statistical analyzes were performed with the X2 test to determine statistically significant differences between the presence of these microorganisms and sociodemographic characteristics. Results: Mbb, Ca alvus, Cp220, kc5a were positive in 8%, 25%, 42% and 36%, with an average concentration of 43735, 324.9, 44.03 and 33.68 respectively. Mbb and Ca alvus showed statistically significant differences compared to oral sex (p: 0.0431) and gastroesophageal reflux (p: 0.04965) respectively. Conclusion: Archaea and virus disease candidates had a frequency of 8% and 36% respectively. while archaea and health-related viruses presented a frequency of 25% and 42%.
Cobertura espacial (cidades)
Bogotá (Colombia)Cobertura espacial (municípios da Colômbia)
Bogotá, D.C. (Bogotá, Colombia)Cobertura espacial (departamentos da Colômbia)
Cundinamarca (Colombia)Cobertura Espacial
ColombiaTemas
Especialización en patología y cirugía bucal - Tesis y disertaciones académicasNeoplasias de la boca
Neoplasias de la boca - Diagnóstico
Google Analytics Statistics