Validación de caracteres morfológicos diagnósticos y estandarización de condiciones de PCR de marcadores mitocondriales, para la identificación de tres subespecies de Amazona ochrocephala (A. o. ochrocephala, A. o. nattereri, A. o. panamensis) Psittacidae, Aves
Date
2020-06-11Authors
Jaramillo Castaño, María JoséEvaluators
Carrillo Rivera, NataliaPublisher
Pontificia Universidad Javeriana
Faculty
Facultad de Ciencias
Program
Biología
Type
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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English Title
Validation of diagnostic morphological characters and standardization of PCR conditions of mitochondrial markers, for the identification of three subspecies of Amazona ochrocephala (A. o. ochrocephala, A. o. nattereri, A. o. panamensis) Psittacidae, AvesResumen
Amazona ochrocephala o “Lora real” es el ave más traficada en varias regiones de Colombia. Considerando la disminución de sus poblaciones naturales y el número de individuos decomisados, se busca favorecer protocolos de liberación. Sin embargo, la delimitación de sus subespecies mediante caracteres morfológicos resulta ambigua, dificultando la determinación del lugar de liberación. En el presente estudio se realizó la validación de los caracteres morfológicos que permiten diferenciar tres subespecies de A. ochrocephala, y se estandarizaron las condiciones de PCR para tres marcadores mitocondriales que posibilitan la identificación molecular de las subespecies. El análisis multivariado mostró que las medidas morfométricas por sí solas no discriminan entre subespecies, pero que estas combinadas con los caracteres cualitativos generan agrupaciones (no compactas) correspondientes a las subespecies morfológicas. Se encontraron los intervalos de valores óptimos de temperatura de anillamiento y volumen de ADN que permiten obtener los amplificados esperados. Los caracteres cualitativos (presentados en la clave taxonómica elaborada) parecen tener un mayor poder de discriminación. Se recomienda realizar una colorimetría para la especie y un estudio en sistemática molecular con las condiciones encontradas.
Abstract
Amazona ochrocephala or "Lora real" is the most illegally trafficked bird across several regions of Colombia. Considering the decline in their natural populations and the number of confiscated individuals, there is interest in promote release protocols. However, the delimitation of their subspecies by morphological characters is ambiguous, making it difficult to determine the release area. In the present study, a validation of the morphological characters that make it possible to differentiate three subspecies of A. ochrocephala was executed, and the PCR conditions for three mitochondrial markers that enable the molecular identification of the subspecies were standardized. The multivariate analysis showed that the morphometric measures on their own do not discriminate between subspecies, but that these combined with the qualitative characters generate (non-compact) groupings corresponding to the morphological subspecies. The ranges of optimal annealing temperature and DNA volume values that allow the expected amplifications to be obtained were found. The qualitative characters (presented in the elaborated taxonomic key) seem to have a greater discrimination power. It is recommended to carry out a colorimetry for the species and to run a study in molecular systematics with the conditions found.
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