Genotipificación de 14 variedades de arroz (oryza sativa) mediante marcadores moleculares aflp
Date
2008Tipo
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - PregradoShare this record
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Resumen
Con el fin de determinar la utilidad de la técnica AFLP como herramienta de soporte para los diagnósticos morfológicos en variedades pertenecientes al programa de Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales del Instituto Colombiano Agropecuario -ICA-, se genotipificó una población constituida por 14 variedades de arroz (O. Sativa). Se probaron dos nuevas combinaciones de iniciadores AFLP y cuatro reportadas en literatura, evidenciándose la mayor resolución y porcentaje de polimorfismo con las combinaciones E-AGC, M-CAC y E-AAC, M-CTA, los resultados obtenidos arrojaron un polimorfismo entre 60 y 100%, con un rango de 25-46 bandas totales y cinco bandas únicas, datos afines con la literatura y estudios recientes adelantados por el ICA con marcadores moleculares RAMS. Se construyeron dendogramas empleando el coeficiente de Dice y el algoritmo UPGMA, lo que permitió evidenciar el agrupamiento de las variedades Oryzica Caribe 8, Oryzica Yacu-9, Oryzica 1, Progreso 4-25, Inproarroz 1525, Coprosem 1 y Aceituno 25-40, en el cual los mayores porcentajes de similaridad se presentaron entre las variedades Oryzica 1, Aceituno 25-40 y Coprosem 1, con más del 90%. Las variedades Coprosem 2 y Selecta se mostraron como las más disímiles. La técnica AFLP permitió establecer diferencias entre las variedades de estudio, poniendo en evidencia su capacidad para diferenciar genotipos o variedades previamente establecidas y de esta forma contribuir y apoyar las pruebas de distinción, homogeneidad y estabilidad (DHE) empleadas en el programa de Protección a los Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales.
Abstract
In order to determine AFLP technique usefulness as support tool for morphological diagnosis of varieties belonging to the Plant Varieties Breeder's Right Protection Programs of Colombian Agricultural Institute -ICA-, a population consisting of 14 varieties of rice (O. Sativa) was genotyped through AFLP molecular markers. Two new primer combinations of AFLP and six reported in literature were tested, finding the highest resolution and polymorphism percentage with E-AGC, M-ACC and E-AAC, MCTA combinations, the obtained results revealed a polymorphism between 60 and 100%, 25-46 total bands and five unique bands. These data show affinity with those found in literature and recent studies with Random Amplified Microsatellites (RAMs) developed by ICA. Cluster analysis was constructed using UPGMA algorithm and Dice coefficient, which resulted in the formation of a single group that includes Oryzica Caribe 8, Oryzica Yacu-9, Oryzica 1, Progreso 4-25, Inproarroz 1525, Coprosem 1 and Aceituno 25-40 varieties, largest percentages of similarity over 90% were presented by Oryzica 1, Aceituno 25-40 and Coprosem 1. The varieties Coprosem 2 and Selecta were the most dissimilar. The AFLP technique allowed to establish differences between the study varieties, putting in evidence the ability to differentiate genotypes or varieties previously recognized, therefore contribute to the characterization studies developed by Plant Varieties Breeder's Right Protection Programs.
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