Predicción de crisis epilépticas mediante teoría de grafos y conectividad funcional

Date
2018Authors
Peña Campos, Johan SebastiánPublisher
Pontificia Universidad Javeriana
Faculty
Facultad de Ingeniería
Facultad de Arquitectura y Diseño
Facultad de Ciencias
Facultad de Medicina
Facultad de Odontología
Program
Maestría en Bioingeniería
Maestría en Ingeniería Electrónica
Obtained title
Magíster en Bioingeniería
Magíster en Bioingeniería
Type
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestría
COAR
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Citación
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Resumen
El comportamiento anormal de redes neuronales causa la ocurrencia de crisis espontáneas y
recurrentes, principal síntoma de la epilepsia. La dinámica de estas redes epilépticas y los
mecanismos detrás de la generación de las crisis, son temas de gran interés en la comunidad
médica y científica, dado que aún no han sido completamente descubiertos ([1], [2], [3]). En el
presente trabajo, se hace uso de los datos de la base EPILEPSIAE [4] recolectados de 10
pacientes usando electroencefalogramas intracraneales. Se analizan datos de 8 horas antes
de la crisis, con una frecuencia de muestreo de 1024 Hz. Adicionalmente, se usan datos de 5
pacientes del Hospital Universitario San Ignacio (HUSI), correspondientes a un intervalo de 3
horas antes de la crisis a una frecuencia de muestreo de 256 Hz.
Para este fin, se propone una metodología en la cual se estudian redes de conectividad que
son construidas a partir de medidas de similitud multivariable entre canales de la
sincronización cerebral. Estas características se analizan entre todas las posibles
combinaciones de los canales para cada una de las bandas cerebrales fisiológicas.
Las redes de conectividad construidas, se filtran usando un umbral estadístico. Con las
matrices resultantes se calculan las medidas topológicas de la red. Estas medidas son
utilizadas para analizar la dinámica de las redes cerebrales, en ventanas de tiempo de 1
minuto, buscando encontrar el marcador cerebral que permita anticipar la ocurrencia de una
crisis epiléptica o etapa ictal. Finalmente, estas medidas se usan como variables de entrada a
un módulo de aprendizaje de máquina para realizar clasificación automática.
Adicionalmente, se estudia la dinámica de la red a lo largo del tiempo, buscando encontrar
marcadores que permitan aportar al conocimiento del fenómeno.
Abstract
Abnormal behavior of neural networks causes the occurrence of spontaneous and recurrent
seizures, the main symptom of epilepsy. The dynamics of these epileptic networks and the
mechanisms behind the generation of seizures are subjects of great interest in the medical and
scientific community, since they have not yet been completely discovered ([1], [2], [3]). In the
present work, it is made use of the data of the base epilepsy [4] collected from 10 patients
using intracranial electroencephalograms. Data are analyzed 8 hours before the seizure, with
a sampling frequency of 1024 Hz. Additionally, data from 5 patients from the San Ignacio
University Hospital (HUSI), corresponding to an interval of 3 hours before to the seizure, are
used at a sampling rate of 256 Hz.
To this end, it proposes a methodology in which we study networks of connectivity that are built
from measures of multivariate similarity between channels of the cerebral synchronization.
These characteristics are analyzed among all the possible combinations of the channels for
each of the physiological cerebral bands.
The built-in connectivity networks are filtered using a statistical threshold. With the resulting
matrices the topological measurements of the network are calculated. These measures are
used to analyze the dynamics of brain networks, in time windows of 1 minute, seeking to find
the brain marker that allows anticipating the occurrence of an epileptic seizure or ictal stage.
Finally, these measurements are used as input variables to a machine learning module to
perform automatic sorting.
In addition, we study the dynamics of the network over time, seeking to find markers that allow
to contribute to the knowledge of the phenomenon.
Themes
Maestría en bioingeniería - Tesis y disertaciones académicasMaestría en ingeniería electrónica - Tesis y disertaciones académicas
Teoría de grafos
Epilepsia
Inteligencia artificial
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