Evaluación de microsatélites para estudios genéticos en psitácidos (Psittacidae) de Colombia
Datum
2020-06-23Autoren
Escobar Guzman, Luisa FernandaEvaluator
Echeverry Galvis, Maria AngelaHerausgeber
Pontificia Universidad Javeriana
Fakultät
Facultad de Ciencias
Programm
Biología
Typ
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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Englischer Titel
Evaluation of microsatellites for genetic studies in psittacids (Psittacidae) of ColombiaZusammenfassung
La familia Psittacidae es el grupo de aves más representado en el tráfico ilegal de fauna silvestre en Colombia. De los individuos decomisados sobrevivientes a este tráfico, algunos pueden ingresar a programas de cría en cautiverio. Sin embargo, en estos programas es muy probable que se presenten casos de depresión por endogamia y se disminuya la variabilidad genética por el desconocimiento del linaje de cada individuo. Para mitigar este problema, los marcadores moleculares tipo microsatélites han sido ampliamente utilizados. Sin embargo, aún no se han diseñado cebadores específicos para microsatélites en las especies con distribución en Colombia. Utilizando amplificación cruzada, se estandarizaron y validaron tres microsatélites AgGT21, AgGT90 y UnaCT32 para 11 especies de psitácidos con distribución en Colombia. Para este propósito, se extrajo el ADN y se amplificaron y visualizaron los fragmentos de estos marcadores en geles de agarosa. De los microsatélites estudiados, dos se estandarizaron y validaron en las 11 especies y el restante únicamente en 7. Los resultados obtenidos en este trabajo indican que los tres microsatélites trabajados son buenos candidatos para realizar análisis genéticos en estas especies de psitácidos.
Abstrakt
The family Psittacidae is the most affected group of birds by the illegal wildlife trade in Colombia. Of the seized individuals that survives to this trade, some may enter to captive breeding programs. However, in these programs it is very likely that cases of inbreeding depression will occur, and genetic variability will decrease due to the lack of knowledge of the lineage of each individual. To mitigate this problem, microsatellite-type molecular markers have been commonly used. However, specific primers have not yet been designed for microsatellites in species of psittacids with distribution in Colombia. Using cross-amplification, three microsatellites AgGT21, AgGT90 and UnaCT32 were standardized and validated for 11 species of psittacids distributed in Colombia. For this purpose, DNA was extracted, and the fragments of these markers were amplified and visualized on agarose gels. Of the microsatellites studied, two were standardized and validated in the 11 species and the remaining just in 7. The results of this work indicate that the three microsatellites are good candidates for performing genetic analyzes on these species of psittacids.
Räumliche Abdeckung
ColombiaThemen
Biología - Tesis y disertaciones académicasLoros - Colombia
Microsatélites
Conservación biológica - Colombia
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