Computación de alto desempeño aplicada en técnicas de simulación de proteínas

Abstract

Se busca estudiar alternativas de computación de alto desempeño (HPC) viables en la PUJ para generar opciones que permitan potenciar la e-Science y el trabajo interdisciplinario. Para ello se revisó el estado del arte y la necesidad de HPC, observando posibles problemas que demuestren las ventajas de tener un sistema con estas características, se diseñó un experimento de simulación utilizando clusters computacionales diferenciados según capacidad y cantidad de procesadores| se seleccionaron las moléculas según resultados experimentales, se seleccionaron variables independientes, dependientes e intervinientes para preparar y configurar las simulaciones. Se desarrollaron scripts y programas para replicar configuraciones en las máquinas.