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Carbapenem resistance in Enterobacterales bloodstream infections among children with cancer or post-haematopoietic stem cell transplant: a retrospective cohort study

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dc.contributor.authorLópez-Cubillos, Juan F
dc.contributor.authorDíaz, Alejandro
dc.contributor.authorCárdenas, Vicky C
dc.contributor.authorCamacho-Moreno, German
dc.contributor.authorCantor, Erika
dc.contributor.authorArcila, Eliana M
dc.contributor.authorHurtado, Isabel C
dc.contributor.authorCorrea, Adriana M
dc.contributor.authorTierradentro, Tatiana M
dc.contributor.authorRamirez, Oscar
dc.contributor.authorPortilla, Carlos A
dc.contributor.authorAponte-Barrios, Nelson
dc.contributor.authorLópez, Pio
dc.contributor.authorTorres, Daniela
dc.contributor.authorBustos-Paz, Mario
dc.contributor.authorBravo, Ana M
dc.contributor.corporatenamePontificia Universidad Javeriana. Facultad de Medicina. Departamento de Epidemiología Clínica y Bioestadísticaspa
dc.date.accessioned2024-01-24T13:24:34Z
dc.date.available2024-01-24T13:24:34Z
dc.date.created2023-10
dc.description.abstractBackground Risk factors for carbapenem resistance in Enterobacterales bloodstream infections among children with cancer or post-HSCT have not been thoroughly explored. Methods All children with cancer or post-HSCT who developed Enterobacterales bloodstream infections in two cancer referral centres in major Colombian cities between 2012 and 2021 were retrospectively examined. When the infection episode occurred, carbapenem resistance mechanisms were evaluated according to the available methods. Data were divided in a training set (80%) and a test set (20%). Three internally validated carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) prediction models were created: a multivariate logistic regression model, and two data mining techniques. Model performances were evaluated by calculating the average of the AUC, sensitivity, specificity and predictive values. Results A total of 285 Enterobacterales bloodstream infection episodes (229 carbapenem susceptible and 56 carbapenem resistant) occurred [median (IQR) age, 9 (3.5–14) years; 57% male]. The risk of CRE was 2.1 times higher when the infection was caused by Klebsiella spp. and 5.8 times higher when a carbapenem had been used for ≥3 days in the previous month. A model including these two predictive variables had a discriminatory performance of 77% in predicting carbapenem resistance. The model had a specificity of 97% and a negative predictive value of 81%, with low sensitivity and positive predictive value. Conclusions Even in settings with high CRE prevalence, these two variables can help early identification of patients in whom CRE-active agents are unnecessary and highlight the importance of strengthening antibiotic stewardship strategies directed at preventing carbapenem overuse.spa
dc.description.abstractenglishLos factores de riesgo de resistencia a los carbapenémicos en las infecciones del torrente sanguíneo por Enterobacterales entre niños con cáncer o después de un TCMH no se han explorado a fondo. Métodos Se examinaron retrospectivamente todos los niños con cáncer o post-TCMH que desarrollaron infecciones del torrente sanguíneo por Enterobacterales en dos centros de referencia de cáncer en las principales ciudades de Colombia entre 2012 y 2021. Cuando ocurrió el episodio de infección, se evaluaron los mecanismos de resistencia a los carbapenémicos según los métodos disponibles. Los datos se dividieron en un conjunto de entrenamiento (80%) y un conjunto de prueba (20%). Se crearon tres modelos de predicción de Enterobacterales resistentes a carbapenémicos (CRE) validados internamente: un modelo de regresión logística multivariante y dos técnicas de minería de datos. El rendimiento del modelo se evaluó calculando el promedio del AUC, la sensibilidad, la especificidad y los valores predictivos. Resultados Se produjeron un total de 285 episodios de infección del torrente sanguíneo por Enterobacterales (229 susceptibles a carbapenémicos y 56 resistentes a carbapenémicos) [mediana de edad (RIQ), 9 (3,5 a 14) años; 57% hombres]. El riesgo de CRE fue 2,1 veces mayor cuando la infección fue causada por Klebsiella spp. y 5,8 veces mayor cuando se había utilizado un carbapenem durante ≥3 días en el mes anterior. Un modelo que incluía estas dos variables predictivas tuvo un rendimiento discriminatorio del 77% en la predicción de la resistencia a los carbapenémicos. El modelo tuvo una especificidad del 97% y un valor predictivo negativo del 81%, con baja sensibilidad y valor predictivo positivo. Conclusiones Incluso en entornos con una alta prevalencia de CRE, estas dos variables pueden ayudar a la identificación temprana de pacientes en quienes los agentes activos de CRE son innecesarios y resaltar la importancia de fortalecer las estrategias de administración de antibióticos dirigidas a prevenir el uso excesivo de carbapenémicos.spa
dc.description.esciSispa
dc.description.indexingN/Aspa
dc.description.quartilescopusQ1spa
dc.description.quartilewosQ1spa
dc.formatPDFspa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifierhttps://academic.oup.com/jac/article/78/10/2462/7242636?login=truespa
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1093/jac/dkad255spa
dc.identifier.instnameinstname:Pontificia Universidad Javerianaspa
dc.identifier.issn03057453spa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianaspa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repository.javeriana.edu.cospa
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10554/66135
dc.language.isoengspa
dc.relation.citationendpage2470spa
dc.relation.citationissue10spa
dc.relation.citationstartpage2462spa
dc.relation.citationvolume78spa
dc.relation.ispartofjournalJournal of Antimicrobial Chemotherapyspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
dc.rights.licenceAtribución-NoComercial 4.0 Internacional*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/*
dc.subjectinfeccionesspa
dc.subjectsanguíneo por enterobacteralesspa
dc.subjectsanguíneo por enterobacteralesspa
dc.subjectestudio de cohorte retrospectivospa
dc.subject.keywordretrospective cohort studspa
dc.subject.keywordinfectionsspa
dc.titleCarbapenem resistance in Enterobacterales bloodstream infections among children with cancer or post-haematopoietic stem cell transplant: a retrospective cohort studyspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1spa
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.localArtículo de revistaspa

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