dc.contributor.advisor	Angel Uribe, Juana
dc.contributor.advisor	Franco Cortés, Manuel Antonio
dc.contributor.author	Bautista Lopez, Diana Marcela
dc.contributor.evaluator	Arana, Eloisa Irene
dc.contributor.evaluator	Tobón García, Gabriel Jaime
dc.contributor.evaluator	Vasquéz Duque, Gloria Maria
dc.contributor.evaluator	Quijano Gómez, Sandra
dc.contributor.evaluator	Rojas Vasquez, Olga Lucía
dc.coverage.city	Bogotá (Colombia)	spa
dc.coverage.department	Cundinamarca (Colombia)	spa
dc.coverage.region	Bogotá, D.C. (Bogotá, Colombia)	spa
dc.coverage.spatial	América del Sur	spa
dc.date.accessioned	2022-08-04T11:33:11Z
dc.date.available	2022-08-04T11:33:11Z
dc.date.created	2022-01-28
dc.description.abstract	Las células B (CB) son un componente primordial de la respuesta inmune innata y adaptativa. Las CB CD27+IgM+IgD+ han sido implicadas en la respuesta inmune frente a diferentes patógenos. Por lo tanto, se hace necesario estudiar en detalle esta población en ausencia de enfermedad, para posteriormente entenderlas en los diferentes contextos patológicos. El origen, función y repertorio de genes de inmunoglobulinas (Ig) de las CB CD27+IgM+IgD+ circulantes en humanos es controversial y ha sido considerada por otros y por nosotros como una población heterogénea. A pesar de que se ha referido dicha heterogeneidad, poco se sabe sobre las fracciones de células que conforman esta población. Trabajos previos del grupo mostraron que las CB CD27+IgM+IgD+ pueden dividirse en dos subpoblaciones con base en la expresión de IgM e IgD: CD27+IgM++IgD+ (IgMhi) y CD27+IgM+IgD++ (IgMlo) y que las CB específicas de rotavirus están enriquecidas en la subpoblación IgMhi. Otro estudio dividió estas poblaciones de manera similar y evaluó su fenotipo, pero no existe información acerca del transcriptoma, del repertorio de genes de Ig y de su localización, entre otros. Por lo anterior, en este trabajo se comparó el transcriptoma y repertorio de genes de Ig de CB humanas circulantes IgMhi e IgMlo en adultos sanos y se evaluó la frecuencia y la expresión de marcadores de migración en células provenientes de individuos con antecedentes de apendicectomía y/ó amigdalectomía e individuos sin estos antecedentes. El análisis del transcriptoma se realizó mediante el arreglo Clariom D de affymetrix. Para la evaluación de los genes de Ig se amplificaron inicialmente las secuencias de interés mediante 5’RACE-PCR y las librerías generadas se sometieron a secuenciación utilizando la plataforma MiSeq de Illumina. El análisis de secuencias fue realizado usando IgRec e IMGT. Por otro lado, se configuró un panel de 24 colores para evaluar la expresión de marcadores de migración y otros marcadores por citometría espectral. El análisis transcriptómico mostró que ambas poblaciones tienen perfiles cercanos entre sí y con poblaciones que han pasado por el centro germinal, pero difieren en la expresión de 78 genes. Las CB IgMhi tuvieron frecuencias mutacionales más altas en los genes IGHV e IGKV que las IgMlo, pero las IgMlo presentaron un uso preferencial por el segmento IGHJ6. Ambas poblaciones difirieron en sus propiedades del HCDR3, pero las CB IgMhi compartieron la mayoría de sus clonotipos IGH con las CB de memoria solo IgM, y las IgMlo con las solo IgM. Fenotípicamente, estas poblaciones fueron diferentes en 14 marcadores, incluidos los marcadores de migración, α4β7, CCR9 y CD22. Además, identificamos menores frecuencias de CB IgMlo y CB IgMhi en individuos apendicectomizados y/ó amigdalectomizados. Estos resultados apoyan la idea de que la expresión diferencial de IgM e IgD discrimina dos subpoblaciones de CB CD27+IgM+IgD+ circulantes: las CB IgMhi tienen similitudes con CB de la zona marginal que han pasado por centro germinal y las CB IgMlo son menos diferenciadas. Las menores frecuencias de las CB IgMhi y CB IgMlo y células IgMhi que expresan CCR9 en individuos apendicectomizados y/ó amigdalectomizados sugiere que el apéndice y/ó amígdalas son importantes para el desarrollo de estas células.	spa
dc.description.abstractenglish	B cells (Bc) are a major component of the innate and adaptive immune response. CD27+IgM+IgD+ Bc have been implicated in the immune response against different pathogens. It is necessary to study this population in detail in the absence of disease, in order to later understand it in the different pathological contexts. The origin, function and repertoire of immunoglobulin (Ig) genes of circulating CD27+IgM+IgD+ Bc in humans is controversial and has been considered by others and by us as a heterogeneous population. Although this heterogeneity has been reported, little is known about the cell fractions that compose this population. Previous work by the group showed that CD27+IgM+IgD+ Bc can be divided into two subpopulations based on IgM and IgD expression: CD27+IgM++IgD+ (IgMhi) and CD27+IgM+IgD++ (IgMlo) and that rotaviruses specific Bc are enriched in the IgMhi subpopulation. Another study divided these populations in a similar way and evaluated their phenotype, but there is no information about the transcriptome, Ig genes repertoire and their location. Therefore, in this work the transcriptome and Ig gene repertoire of circulating human IgMhi and IgMlo Bc in healthy adults were compared and the frequency and expression of migration markers in cells from individuals with a history of appendectomy and/or tonsillectomy and individuals without this history. The transcriptome analysis was performed using the affymetrix Clariom D array. For the evaluation of Ig genes, the sequences of interest were initially amplified by 5'RACE-PCR and the generated libraries were subjected to sequencing using the Illumina MiSeq platform. Sequence analysis was performed using IgRec and IMGT. On the other hand, a panel of 24 colors was configured to evaluate the expression of migration markers and other markers by spectral cytometry. The transcriptomic analysis showed that both populations have profiles close to each other and to populations that have passed through the germinal center, but differ in the expression of 78 genes. IgMhi Bc had higher mutational frequencies in the IGHV and IGKV genes than IgMlo, but IgMlo showed preferential use by the IGHJ6 segment. Both populations differed in their HCDR3 properties, but IgMhi Bc shared most of their IGH clonotypes with IgM-only memory Bc, and IgMlo with IgM-only Bc. Phenotypically, these populations were different in 14 markers, including migration markers, α4β7, CCR9, and CD22. In addition, we identified lower frequencies of IgMlo and IgMhi Bc in appendectomized and/or tonsillectomized individuals. These results support the idea that the differential expression of IgM and IgD discriminates between two subpopulations of circulating CD27+IgM+IgD+ Bc: IgMhi Bc have similarities with marginal zone Bc that have passed through the germinal center, and IgMlo Bc are less differentiated. Lower frequencies of IgMhi and IgMlo Bc and IgMhi cells expressing CCR9 in appendectomized and/or tonsillectomized individuals suggests that the appendix and/or tonsils are important for the development of these cells.	spa
dc.description.degreelevel	Doctorado	spa
dc.description.degreename	Doctor en Ciencias Biológicas	spa
dc.description.sponsorship	Pontificia Universidad Javeriana	spa
dc.description.sponsorship	Colciencias	spa
dc.description.sponsorship	Agencia Presidencial de Cooperación Internacional de Colombia-APC Colombia	spa
dc.description.sponsorship	Fundación Bolivar Davivienda	spa
dc.description.sponsorship	Cytek Biosciences	spa
dc.description.sponsorship	Asociación Colombiana de Inmunología	spa
dc.format	PDF	spa
dc.format.mimetype	application/pdf	spa
dc.identifier.instname	instname:Pontificia Universidad Javeriana	spa
dc.identifier.reponame	reponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana	spa
dc.identifier.repourl	repourl:https://repository.javeriana.edu.co	spa
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10554/61132
dc.language.iso	spa	spa
dc.publisher	Pontificia Universidad Javeriana	spa
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias	spa
dc.publisher.program	Doctorado en Ciencias Biológicas	spa
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_f1cf	spa
dc.rights.licence	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional	*
dc.rights.local	De acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.	spa
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	*
dc.subject	Células B de la zona marginal	spa
dc.subject	Moléculas de superficie celular	spa
dc.subject	Expresión génica	spa
dc.subject	Repertorio de genes de inmunoglobulinas	spa
dc.subject	Marcadores de migración	spa
dc.subject	Citometría de flujo espectral	spa
dc.subject	Apendicectomía	spa
dc.subject	Amigdalectomía	spa
dc.subject	Humano	spa
dc.subject	Sangre	spa
dc.subject.armarc	Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas	spa
dc.subject.armarc	Expresión génica	spa
dc.subject.armarc	Apendicetomía	spa
dc.subject.armarc	Amigdalectomía	spa
dc.subject.armarc	Linfocitos B	spa
dc.subject.keyword	Marginal zone B cells	spa
dc.subject.keyword	Cell surface molecules	spa
dc.subject.keyword	Gene expression	spa
dc.subject.keyword	Ig gene repertoire	spa
dc.subject.keyword	Homing receptors	spa
dc.subject.keyword	Appendectomy	spa
dc.subject.keyword	Tonsillectomy	spa
dc.subject.keyword	Spectral flow cytometry	spa
dc.subject.keyword	Human	spa
dc.subject.keyword	Blood	spa
dc.title	Caracterización del fenotipo, transcriptoma y repertorio de genes de inmunoglobulinas de células B humanas CD27+IgM+IgD+ circulantes y evaluación de su frecuencia en individuos con apendicectomía y/ó amigdalectomía	spa
dc.title.english	Characterization of the phenotype, transcriptome and immunoglobulin genes repertoire from circulating CD27+IgM+IgD+ human B cells and evaluation of their frequency in individuals with appendectomy and/or tonsillectomy	spa
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.type.driver	info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctorado	spa

Caracterización del fenotipo, transcriptoma y repertorio de genes de inmunoglobulinas de células B humanas CD27+IgM+IgD+ circulantes y evaluación de su frecuencia en individuos con apendicectomía y/ó amigdalectomía

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