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Study of potential blocking peptides targeting the SARS-CoV-2 RBD/hACE2 interaction

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dc.contributor.advisorAlméciga Díaz, Carlos Javier
dc.contributor.advisorEspejo Mojica, Angela Johana
dc.contributor.authorVillada Troncoso, Sara Melissa
dc.contributor.evaluatorPoutou Piñales, Raúl Alberto
dc.contributor.evaluatorCastillo Ramírez, Jorge Andrés
dc.contributor.evaluatorBedoya López, Andrea
dc.date.accessioned2024-09-13T16:29:25Z
dc.date.available2024-09-13T16:29:25Z
dc.date.created2024-07-07
dc.description.abstractSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the causative agent of COVID-19, was declared a public health emergency in early 2020. The infection initiates when the receptor-binding domain (RBD) of the viral Spike protein binds to human angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2). Despite the success of vaccination efforts, the emergence of new variants highlights the ongoing need for treatments targeting these evolving strains. In silico methods three peptides were previously identified—BP2, BP9, and BP11—capable of disrupting the RBD-ACE2 interaction, though their efficacy has not been experimentally validated until now. In this study, these peptides were recombinantly produced in Komagataella phaffii and purified via affinity chromatography. Their activity was assessed by binding assays with multiple RBD variants and inhibition of the RBD-ACE2 interaction. BP2 showed the highest production yield and exhibited superior affinity and the lowest IC50 among the peptides tested. These results suggest that BP2, in particular, holds promise for developing new therapeutic approaches against SARS-CoV-2 and related coronaviruses.spa
dc.description.abstractenglishSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the causative agent of COVID-19, was declared a public health emergency in early 2020. The infection initiates when the receptor-binding domain (RBD) of the viral Spike protein binds to human angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2). Despite the success of vaccination efforts, the emergence of new variants highlights the ongoing need for treatments targeting these evolving strains. In silico methods three peptides were previously identified—BP2, BP9, and BP11—capable of disrupting the RBD-ACE2 interaction, though their efficacy has not been experimentally validated until now. In this study, these peptides were recombinantly produced in Komagataella phaffii and purified via affinity chromatography. Their activity was assessed by binding assays with multiple RBD variants and inhibition of the RBD-ACE2 interaction. BP2 showed the highest production yield and exhibited superior affinity and the lowest IC50 among the peptides tested. These results suggest that BP2, in particular, holds promise for developing new therapeutic approaches against SARS-CoV-2 and related coronaviruses.spa
dc.description.degreelevelMaestríaspa
dc.description.degreenameMagíster en Ciencias Biológicasspa
dc.description.sponsorship“Agencia Distrital para la Educación Superior, la Ciencia y la Tecnología (ATENEA)”spa
dc.formatPDFspa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.instnameinstname:Pontificia Universidad Javerianaspa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianaspa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repository.javeriana.edu.cospa
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10554/68460
dc.language.isospaspa
dc.publisherPontificia Universidad Javerianaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Cienciasspa
dc.publisher.programMaestría en Ciencias Biológicasspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
dc.rights.licenceAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional*
dc.rights.localDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.spa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectCOVID-19spa
dc.subjectSARS-CoV-2spa
dc.subjectBlocking peptidesspa
dc.subjectKomagataella phaffiispa
dc.subject.armarcMaestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasspa
dc.subject.armarcCOVID-19 (Enfermedad)spa
dc.subject.keywordCOVID-19spa
dc.subject.keywordSARS-CoV-2spa
dc.subject.keywordBlocking peptidesspa
dc.subject.keywordKomagataella phaffiispa
dc.titleStudy of potential blocking peptides targeting the SARS-CoV-2 RBD/hACE2 interactionspa
dc.title.englishStudy of potential blocking peptides targeting the SARS-CoV-2 RBD/hACE2 interactionspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríaspa

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